DrawMol para Mac

DrawMol es una poderosa interfaz gráfica para visualizar y construir estructuras moleculares.

Características

• Construye una estructura molecular desde cero
  • Construye una estructura haciendo clic y arrastrando para agregar átomos y enlaces.
  • Luego puedes refinar tu estructura con un solo clic utilizando la optimización del campo de fuerza UFF. Al construir una estructura, DrawMol puede adivinar el tipo de enlaces (simples, dobles, triples o aromáticos) o puedes forzarlo haciendo clic en un enlace.
  • Además, los átomos de hidrógeno se pueden agregar automáticamente
  • Guarda tu estructura en formato xyz o construye un archivo de entrada de gaussian o gamess directamente.
  • Para Gamess, si el programa está instalado localmente, incluso puedes lanzar el trabajo desde DrawMol (en segundo plano) y seguir la progresión del trabajo.
  • Pega directamente una estructura en el Editor Cartesiano de DrawMol. Puede reconocer formatos XYZ, Gaussian, Gamess, Turbomole y Z-matrix.
  • El Editor Cartesiano también se puede usar para exportar la estructura en cualquiera de estos formatos, así como para modificar una estructura dada agregando/removiendo algunos átomos o cambiando el elemento de un átomo dado.
  • Importa una estructura de la base de datos ChemSpider
• Visualiza la estructura molecular así como las propiedades moleculares
  • Abre formatos de archivo XYZ, molfile MDL, log de Gaussian, fchk de Gaussian, log de Gamess, salida de Dalton, salida de Molpro.
  • Además de la estructura molecular, DrawMol puede leer varias propiedades moleculares (por ahora solo disponibles para el formato de archivo fchk de Gaussian):
    • Cargas de Mulliken
    • Momento dipolar
    • Polarizabilidad y primera hiperpolarizabilidad
    • Modos normales vibracionales
    • Blindajes magnéticos (NMR)
    • Orbitales moleculares del conjunto base y coeficientes LCAO
    • Visualiza propiedades moleculares:
    • Etiquetas de átomos
    • Cargas de Mulliken
    • Desplazamientos químicos de NMR
    • Vector de momento dipolar
    • Vector beta
    • Representación de esfera unitaria de la polarizabilidad y hiperpolarizabilidad
    • Desplazamientos atómicos de modos normales vibracionales a través de vectores, esferas o incluso animación
    • Superficies isos de orbital molecular
    • Abre archivos de cubo gaussianos y visualiza superficies isos de los datos almacenados.
• Además, DrawMol proporciona algunas herramientas para:
  • Hacer que dos moléculas o fragmentos coincidan entre sí utilizando un procedimiento de coincidencia (enfoque de mínimos cuadrados)
  • Orientar el eje Z de una molécula para que sea perpendicular a un plano formado por tres o más átomos o pase a través de dos o más átomos utilizando un enfoque de mínimos cuadrados.
• Guardar cualquier estructura
  • Como una imagen ya sea en png, tiff, jpeg o dae (Collada)
  • Como una película para la animación de los modos normales
  • Como archivos XYZ, CIF, PDB
  • Como un archivo limol. Este formato es básicamente un contenedor HDF5 que almacena todas las propiedades moleculares así como las preferencias de visualización.
  • Este archivo puede ser leído por DrawMol pero también puede ser analizado fácilmente utilizando C, Fortran, Python, ... e incluso volcado (con la utilidad lidump) en un archivo ASCII.